Los zoids son máquinas de lucha parecidas a bestias que se utilizan tanto en el uso diario, como en el transporte, como en usos especiales, como la guerra. Algunos tipos de zoides, conocidos como organoides, son zoides en miniatura que son organismos vivos. Estos organoides tienen la capacidad de fusionarse con un zoid no vivo y hacerlo mucho más potente.

Van (Ban) Freiheit descubre un organoide Zoid en un laboratorio abandonado mientras huye de dos extraños que pilotean Zoids. También en el laboratorio, en un tubo de suspensión animado hay una extraña