Cuando la recién elegida presidenta del Consejo Estudiantil, Medaka Kurokami, instituye su idea de un buzón de sugerencias donde las personas pueden presentar problemas que deben resolverse, espera cosas como rescatar cachorros perdidos y dar consejos. Sin embargo, lo que ella y su mejor amiga Zenkichi encuentran son los primeros indicios de un secreto increíble, ¡y su escuela, la Academia Hakoniwa y la propia Medaka están de alguna manera en el centro de la creciente vorágine! A medida que lo que parecía un tiempo pasado inocente se convierte en